Die Organe der Wirtschaftskammer Baselland sind die Delegiertenversammlung, der Wirtschaftsrat Baselland und der Zentralvorstand.

Die Delegiertenversammlung ist das oberste Organ der Wirtschaftskammer. Sie legt die verbandspolitischen Strukturen fest und definiert die strategische und politische Ausrichtung der Wirtschaftskammer.

Der Wirtschaftsrat Baselland ist das Parlament der Baselbieter KMU-Wirtschaft. Er nimmt Stellung zu wirtschafts- und KMU-politisch relevanten Sachfragen, beschliesst Abstimmungsparolen und gibt Wahlempfehlungen ab.

Der Zentralvorstand legt als strategisches Führungsorgan die Grundsätze für die Umsetzung des wirtschaftspolitischen Auftrages der Wirtschaftskammer fest. Er übt die Aufsicht über alle Institutionen der Wirtschaftskammer aus.